PubMedID |
22619280 |
Journal |
Circ Res, 2012 Jun 22;111(1);17-27, |
Title |
Noise-free visualization of microscopic calcium signaling by pixel-wise fitting. |
Author |
Tian Q, Kaestner L, Lipp P |
京都大学医学研究科 病態生物医学 松田道行研 藤田芳久 2012/09/05
画像のノイズ除去について
愛媛大学の井上先生より紹介がありました論文です。画像処理をすこしかじっており興味深く感じたのでコメントいたします。
この研究ではfluo-4プローブを用いて時空間的に高解像度のCa2+ transientを測定しています。1点あたりの露光時間が10ナノ秒程度であるため、ノイズが大きくなります。そこで解像度やkinetic propertyを損なうことのないノイズ除去法が試みられています。測定されたCa2+の時間変化は数式で近似され、その数式により画像を再構築します。数式(近似関数)は3種類試され、フィッティングの結果最も残差の少ない関数を採用しています。フィッティングにはMatlabソフトのfminsearch functionが使われています。
この手法はフィルター処理などの画像処理とは異なり、フィッティングであるため近似関数が必要です。また、ピクセル単位でフィッティングしているため、すべてのピクセルについて一つの関数で近似できる画像データでなければなりません。しかし画像をフィッティングして再構築するという発想は自分には無かったのでおもしろく、参考になりました。